Die Kosten hängen von mehreren Faktoren ab, insbesondere vom Warenart und –wert, Ursprungsland sowie dem gewählten Zollverfahren. Zu den Kosten zählen u. a. Zollabgaben (Zoll, MwSt., Verbrauchsteuer), Verwaltungsgebühren sowie das Entgelt der Zollagentur. Zusätzliche Kosten können entstehen z. B. durch Zollrevisionen, Spezial-Kontrollen oder fehlende Dokumentation. Die Abfertigungskosten werden individuell pro Sendung kalkuliert.
